四月九日，组织二十个师发起夏季攻势，至六月二十七日攻克奉新、靖安、西山万寿宫及高邮市等重要据点，击毙敌混成第十六旅团长藤堂高英少将，有力地配合了第五、六战区同期进行的枣宜会战。在战区主力冬季攻势遭受惨重损失之后，还能取得如此战绩，实属不易。至于苏联顾问福尔根向蒋介石报告所称“宜昌沦陷系薛岳按兵不动所致”实为不了解情况的不实之辞。
十月一九四一年三月，指导第九战区各部进行反扫荡作战，先后取得陈山船埠、九岭、奉新等战役的胜利，收复通城、武宁等县城。
三月十五日二十九日，指挥上高会战。
九月十七日十月八日，进行第二次长沙会战。
十二月二十四日一九四二年一月十日，实施第三次长沙会战。
六月初七月中旬，率五十八军、第四军、第七十九军等部增援翰东，参加浙翰会战。
一九四三年十一月一九四四年一月，率第九十九军、第十军、
第五十八军、第七十二军等部驰援常德会战。
一九四四年五月二十七日一十月二曰，率部参加长衡会战。
衡阳失守前，七月十五日，白崇禧奉蒋介石之命到前线视察，在祁阳黎家坪见到了薛岳。他劝薛岳在衡阳沦陷后调第九战区主力防守湘桂线，同时蒋介石也命令薛岳把第九战区主力拉到湘西，但都被薛岳拒绝。八月衡阳外围撤退时，他把部队拉到了湘东。这件事被时任第九战区参谋长、后来起义的赵子立说成是薛岳“有意避开日军箭头，而跑到湘东去”言下之意说薛岳怕死。这话是站不住脚的。首先，薛岳到湘东之后比以前更加困难：手下仅有已久战疲惫的八个严重缺员的军，而要对付十几万日军战胜之师，防守粤汉线和湘东翰南那么大的地方，其难度可想而知。…
与到湘西去要枪有枪要人有人的情况相比，孰优孰劣，薛岳久经沙场，不会不知道。其次，撤到湘东，实际上是把自己送到了日军的包围圈里，而湘西作战若不利可退入大西南后方，其危险程度相比如何，薛岳不会衡量不出。那为什么薛岳要执意去湘东呢？这一行动的重要性，在以后的战局发展可看出。第一，薛岳将第九战区主力撤到湘东后，将第九十九军、暂二军、第四十四军、
第四军、第三十七军等五个军留在了粤汉线以东，缓解了该区域兵力不足的窘境，为日后保卫粤汉线（南段）和翰南保存了重要力量。第二江西是抗日反攻的一个重要基地，也是国共争奔的焦点。’将第九战区主力西调就等于将江西拱手让人，也就不会有后来的翰江追击战和击溃八路军南下支队的战果了。由此看来，第九战区司令部撤向湘东这一决策是有战略远见的。
一九四五年一月三月，率第九战区主力参加了湘粤翰会战。
六月八月，组织实施翰江追击战。
八月九月，在南昌接受日军投降，并指挥暂二军、第三十七军等部在翰南和湘南击败了八路军南下支队，破坏了中共建立五岭根据地作为即将爆发的内战中的南翼的战略计划。
一九二七年蒋介石清党，薛岳改投李济深第四军，指挥〖镇〗压南昌暴动后南下潮汕的共产党，之后多次参与第四军的反蒋战争。
一九三三年五月，薛岳被蒋介石征召，担任第五军军长参加对〖中〗央苏区的第五次围剿，从此薛岳平步青云，进入军事生涯中的辉煌时期。
十月，他到达南昌，先后任北路军第三路军副总指挥兼第七纵队司令和第一路军代总指挥兼第七纵队司令。次年一月，升任第六路军总指挥。四月，薛岳指挥第六路军先后攻占翰南韶源、上冈、寿华山、兴国、古龙冈，给红军造成了很大损失。十月，又进占石城，直逼瑞金。在连战失利、各路敌军又大兵压境的不利形势下，〖中〗央红军被迫作战略转移，开始了二万五千里长征。
红y主力撤离〖中〗央苏区后，薛岳奉命指挥第六路军和第八纵队追击跟踪追击。
红军进入湖南后，蒋介石任命何键为追剿军总司令，薛岳为前敌总指挥。十一月湘江战役，薛岳率部沿湘桂公路实施侧击和尾击，重创红军后尾的第五军团，俘红三十四师师长陈树湘等。十二月，红军被迫进入贵州。蒋介石听到此消息，大喜，对陈布雷说：“共军入黔我们就可以跟进去，比我们专为图矜用兵还好。”因而红军进占遵义时，薛岳却以剿共的名义兵临贵阳，夺了贵州的省〖主〗席王家烈的权，使得红军有了喘息机会。在此期间，中共〖中〗央在遵义召开了政治局扩大会议，这就是著名的“遵义会议”
遵义会议后，红军进行了四渡赤水战役，利用国民政府和地方军阀的矛盾，渡过金沙江，摆脱了薛岳的追击。这次战役被广为宣传，称为“毛〖主〗席的神来之笔”表面上从战役的进程和结果来看是被薛岳及川滇军阀打败的，但实际意义是中共〖中〗央和〖中〗央红军免于被消灭，并从此在以后的战斗中牢牢地卑握战场的主动权。
红军渡过金沙江后，蒋介石立即组织薛岳和川康军阀所部二十万人进行大渡河会战。但在战役尚未部署就绪之际，红军就已迅速突破了西康省〖主〗席刘文辉的防线，全部渡过了大渡河。
一九三五年七月，蒋介石在成都召开军事会议。会前，薛岳与蒋的高级幕僚在研究了六月红一方面军、红四方面军会师以来的情况后，一致认为：红军下一步的战略目标是北出甘肃，向西北发展。于是，
蒋介石决定将薛岳部北调甘陕，原驻西北的第三路军胡宗南部归薛岳指挥。果不出所料，九月中共〖中〗央率红一军团、红三军团突破腊子口，
进入甘肃。由于驻甘南的鲁大昌、王均等部阻击不力，十月红军抵达陕北，与红十五军团会师。但此时，蒋军精锐皆集于西北，红军三个军团加起来才万余人，实力悬殊，中共〖中〗央处境仍很危险。就在这时，蒋介石犯了个致命错误，使中共〖中〗央转危为安。十月底，蒋介石命薛岳东开湖北参加同剿贺龙，将西北剿共军事全权交给张学良，不久张学良与红军妥协，一年后酿成了西安事变。
这年八月到九月间，红四方面军南下，击溃川军主力，先后攻占了宝兴、天全、芦山、荥经、汉源等县，十一月直逼邓崃，威胁成都。
蒋介石被迫命令薛岳停止东进，增援邓崃。十二月，薛岳投入战斗，先后攻克荥经、天全、始阳，解了雅安之围，重创红四方面军，迫使其退入藏区，重陷绝境。至此，薛岳率军对红军追剿宣告结束。
在一九三三年十月至一九三六年二月，前后两年多的时间里，薛岳率部行程两万余里，追击红军两大主力。不但如此，在追击红军的过程中，薛岳还搞垮了贵州军阀王家烈，通过收买西康红教领袖和土司、
留〖中〗央军驻守要地等手段动摇了西康省〖主〗席刘文辉在该省的统治，稳住了云南的省〖主〗席龙云，为蒋介石统一西南立下了汗马功劳，同时也为日后西南抗日大后责的建立打下了良好的基础。为表彰薛岳，一九三七年五月，国民政府任命薛岳为滇卧绥署主任兼贵州的省〖主〗席。